- 北海道（０／１１）
- ００１．礼文島
- ００２．サロベツ原野
- ００３．北オホーツク海岸
- ００４．大雪山
- ００５．知床
- ００６．野付半島
- ００７．釧路湿原
- ００８．オンネトー湖
- ００９．東雲湖
- ０１０．積丹半島
- ０１１．渡島半島北西岸
- 東北（０／１３）
- 青森（０／４）
- ０１２．恐山・仏ガ浦
- ０１３．津軽半島西岸
- ０１４．八甲田山
- ０１５．十二湖・白神山
- 岩手（０／５）
- ０１６．八幡平・乳頭温泉郷
- ０１７．内間木洞
- ０１８．重茂半島
- ０１９．遠野盆地
- ０２０．飛鳥
- 宮城（０／１）
- ０２１．笹谷峠
- 山形（０／１）
- ０２２．出羽三山
- 福島（０／２）
- ０２３．裏磐梯・雄国沼
- ０２４．檜枝岐・野岩鉄道
- 関東（０／９）
- 茨城（０／１）
- ０２５．奥久慈
- 栃木（０／４）
- ０２６．奥鬼怒
- ０２７．奥那須
- ０２８．奥日光
- ０２９．足尾銅山跡
- 群馬（０／１）
- ０３０．尾瀬
- 埼玉（０／１）
- ０３１．奥秩父・両神山
- 東京（０／２）
- ０３２．青ガ島
- ０３３．小笠原
- 中部・北陸（０／２４）
- 新潟（０／２）
- ０３４．佐渡・外海府
- ０３５．上路の里
- 富山（０／３）
- ０３６．黒部峡谷
- ０３７．八尾
- ０３８．五箇山
- 石川（０／２）
- ０３９．白山山麓
- ０４０．能登外浦海岸
- 福井（０／１）
- ０４１．木の芽峠
- 山梨（０／３）
- ０４２．大菩薩峠
- ０４３．青木ガ原樹海
- ０４４．西沢渓谷
- 長野（０／６）
- ０４５．秋山郷
- ０４６．鍋倉山
- ０４７．奥裾花
- ０４８．遠山郷
- ０４９．上高地
- ０５０．木曽路
- 岐阜（０／３）
- ０５１．野麦峠
- ０５２．長良川上流
- ０５３．岩村城跡
- 静岡（０／４）
- ０５４．猫越峠
- ０５５．柿田川
- ０５６．寸又峡
- ０５７．桶ガ谷沼
- 関西（０／１１）
- 三重（０／１）
- ０５８．神島
- 滋賀（０／２）
- ０５９．竹生島
- ０６０．石楠花渓
- 京都（０／２）
- ０６１．芦生原生林
- ０６２．蛭子山古墳
- 兵庫（０／１）
- ０６３．瀞川渓谷
- 奈良（０／２）
- ０６４．十津川郷
- ０６５．大台ヶ原
- 和歌山（０／３）
- ０６６．古座川
- ０６７．熊野古道
- ０６８．裏高野
- 中国（０／７）
- 鳥取（０／１）
- ０６９．氷ノ山西麓
- 島根（０／２）
- ０７０．隠岐・国賀海
- ０７１．島根半島北岸
- 岡山（０／１）
- ０７２．鯉ケ窪湿原
- 広島（０／３）
- ０７３．比婆山
- ０７４．引き明けの森
- ０７５．奥宮島
- 四国（０／９）
- 徳島（０／１）
- ０７６．祖谷
- 香川（０／１）
- ０７７．小豆島
- 愛媛（０／２）
- ０７８．別子銅山跡
- ０７９．佐田岬
- 高知（０／５）
- ０８０．奥物部
- ０８１．千本山
- ０８２．野根山街道
- ０８３．四万十川
- ０８４．大堂海岸
- 九州・沖縄（０／１８）
- 佐賀（０／１）
- ０８５．吉野ケ里遺跡
- 長崎（０／２）
- ０８６．鷹島海底遺跡
- ０８７．五島列島
- 熊本（０／２）
- ０８８．阿蘇
- ０８９．五家荘
- 大分（０／２）
- ０９０．坊がつる
- ０９１．六郷満山
- 宮崎（０／３）
- ０９２．高千穂の里
- ０９３．椎葉の里
- ０９４．銀鏡
- 鹿児島（０／４）
- ０９５．竹島
- ０９６．黒島
- ０９７．屋久島原生林
- ０９８．トカラ列島
- 沖縄（０／４）
- ０９９．石垣島
- １００．竹富島
- １０１．西表島
- １０２．与那国島